Tiene dos partes diferenciadas, una en la que parece una serie policíaca con un misterio a resolver y otra a partir del episodio 5 y sobre todo el 6 donde aparece la realidad con un futuro apocalíptico donde se explican muchas de las acciones de los primeros episodios y con una estructura mucho más dinámica y donde todo comienza a encajar.

Sobre la crítica de Leracounter, juzgando a su vez aspectos de la serie:
1) Su crítica en este punto, ya se ha aclarado en la serie. El propio Pilcher aclara los motivos de su accionar y los resultados de tu propuesta en uno de sus capítulos.
Si se cuenta la verdad, el pueblo se suicida. Si se la esconde, se matan también. Es la moraleja principal de toda la historia: aunque parezca paradójico, fue un error haber salvado a la humanidad. La propuesta de Pilcher falló desde un principio, y haga lo que haga, nada remediará la tristeza de ese pueblo de haber perdido todo lo que resta del mundo y de sus vidas. Pilcher, obsesionado con su proyecto, va a intentar de cualquier manera sostener esa estructura que se cae a pedazos, aún recurriendo a crímenes reprobables por la propia humanidad.
2) El detalle de la fotografía no tiene nada de ilógico. Había helicópteros, bien, ¿Pero cómo sabes si se utilizaron antes o después de la fotografía? Recuerde que estuvieron siglos dormidos en una cubetera, y que cuando despertaron, fue redescubrir el mundo de nuevo: no tenían la total certeza de qué había allí afuera. Es razonable que hayan salido sin tomar conciencia del peligro, o hayan preferido asumir ese riesgo con tal de tomar conocimiento de ese nuevo mundo.
3) Que la mujer no le crea a Ethan cuando le cuenta la verdad, no le veo nada de "inexplicable". En parte, porque todo el ambiente y durante toda la serie, se mantiene un halo de sospecha y desconfianza, ¿Por qué no pensaría lo mismo de Ethan?. Además, pásalo a un plano real: te despiertas de la cama, y te cuentan que el mundo es una mentira, que todo lo que consideras real es una alucinación. ¿Te lo creerías a la primera?
4) Lo que tú consideras "personalidad múltiple", es lo que a mí me parece una personalidad real. No la de los simples "buenos vs malos" que nos obsequian todas las ficciones norteamericanas.
En la realidad, aunque no te lo creas, la gente cambia. Y la gente, también, debe luchar contra dos fuerzas hasta decidirse por un camino. Y muchas veces, uno reprime sus propios deseos, porque está condicionado por los otros. Es precisamente lo que le sucede a la enfermera. Ella acompañó a Pilcher por muchísimo tiempo en su proyecto. Pero luego éste empezó a desbordar, y se dieron consecuencias no bien calculadas, y aquí radican las diferencias entre Pilcher y su hermana.
Es cierto, sí, que esa personalidad sádica del principio tiene un objetivo efectista. Sin embargo, tiene su razón de ser. Y es que en ese capítulo no se está relatando un mundo de manera objetiva. Por más que Wayward Pines fuera color de rosas, no es eso lo que debía mostrarse en la serie, sino la manera en que lo concebía el propio Ethan.
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Puede haber detalles criticables en la serie, nada menos. Pero creo que serían sólo detalles, o no lo suficientemente fuertes como para tirar tan abajo la serie general.
Un error importante, o un desacierto, me parece a mí, es cuando el hijo de Ethan es herido por una bomba. Creo que la situación fue presentada como demasiado "casual". Bien se podría haber recreado la misma situación, pero de una manera más lógica, y por ende con más tinte realista: el accidente no se produce por una casualidad, sino por un intento de ataque contra Ethan, que por error, termina dirigido hacia su hijo.