- Escenas cómicas: McCoy tratando de hacer un pinzamiento vulcaniano.
- Gran escena la de Kirk cayéndose de la silla al saber de la muerte de su hijo: fue idea del propio Shatner. No estaba en el guión, pero quedó bien y se rodó tal y como se ve.
- ¿Qué significa la unión de manos del joven Spock con Saavik?. En la película se nos dice que Spock está pasando el Pon Farr, esto es, cada 7 años los vulcanianos necesitan encontrar a su pareja y copular con ella. En una escena Saavik toca los dedos del joven Spock de una forma especial. ¿Qué pasó después, cosa que no se ve?. En el borrador inicial Saavik quedaba embarazada de Spock y habría otra escena eliminada (creo que en ST: IV donde Saavik volvía con Amanda (la madre de Spock) a la Tierra).
- Fallos del guión: Kirk, Scott, Sulu, etc. se teletransportan al planeta Génesis huyendo de los klingons sin que nadie maneje el transportador cuando sabemos por otros episodios que por lo menos se necesita una persona a los mandos del teletransportador para que el transporte sea efectivo ("espejo, espejito", p.e.). En Star Trek II: Kirk dice que los Klingons no hacen prisioneros pero Kruge en los diálogos al destruir una nave dice que "quería prisioneros". Parece fallo pero no lo es que McCoy quiere comprar una nave a un alienígena con dinero y en Star Trek no existe. Puede ser simplemente que en la Tierra no exista el dinero pero sí en otros planetas, con lo cual McCoy tendrá que usar el "trueque" en otros planetas para dar objetos o joyas valiosas y cosas así a cambio de dinero para luego poder pagar al alienígena.
- Aparición en el bar de los Tribbles.
- La filosofía de la franquicia está muy presente:

* Podemos ver la lealtad/respeto cuando Kirk pide a Sulu, Chekov, etc que no hace falta que ellos sigan adelante, arriesgándose más y que pueden quedarse en la base, y ellos responden con un "estamos perdiendo un tiempo precioso" o "¿cuáles son sus órdenes, almirante?".
* Podemos ver a Kirk diciéndole incluso al asesino de su hijo la frase "deme la mano" cuando ve que éste se va a caer por el precipicio y se la tiende.
* La frase que dice Kirk al final del film, siendo una de las más hermosas de la serie. Spock le pregunta que por qué han hecho eso por él. Kirk realmente responde (en la peli está mal traducido y dice la misma frase que en ST II) que "el bienestar de la minoría supera el bienestar de la mayoría". Así es la tripulación original: todos son una piña, si uno está mal, todos están mal, todos tratan de ayudarse unos a otros, es un alegato en contra del invididualismo que está basado en el "yo estoy muy bien, si tú estás mal es tu problema". Una vez leí que el hombre no será feliz hasta que el dolor de cada hombre sea sentido por todos los hombres, haciendo todos suyo ese dolor. Si fuéramos capaces por interesarnos por nuestro prójimo, si el problema de cada vecino fuera el nuestro y viceversa, todos nos ayudaríamos constantemente y nuestro mundo sería un lugar más hermoso para vivir.