La realidad lineal o destino, y la paralela, dos mundos que pueden tocarse. De hecho, se tocan debido a ¿un fallo en el espacio-tiempo? yo creo que no, debido al sonanbulismo de Donnie, que lo lleva a evitar su destino saliendo de la cama en el momento en que una turbina desprendida de un accidente de avión cae sobre su habitación. Este hecho crea un bucle temporal, o paradoja, que se repite cada 28 días, 6 horas, 24 minutos y 12 segundos. El desaparecido avión tan sólo aparece al final del bucle, por eso no lo encuentran.
Donnie parece llevar así un tiempo. A juzgar por el despertar al comiezo de la peli, parece amanecer tras uno de esos bucles temporales, parece haber estado despertando y viviendo lo mismo cada 28 días, y en efecto es así, durante no sabemos cuánto tiempo. En ese momento aún no lo sabe, no es del todo consciente, tan solo tiene una extraña sensación que él mismo confunde con su "enfermedad mental". A partir de aquí Frank, muerto a causa de un disparo en el ojo, y atrapado también en este universo paralelo, bucle temporal, paradoja o como coño se llame, utilizará a Donnie como una marioneta a través de apariciones, para que éste desencadene los acontecimientos pertinentes para que todo transcurra tal y como ha de transcurrir durante los 28 días, 6 horas etc., y se produzca de nuevo el accidente en casa de Donnie, la caída del motor, causándole la muerte, y permitiendo así continuar la realidad lineal sin sobresaltos para el resto de los humanos.

El punto más oscuro de la peli es el Frank muerto y "tipo raro", del que nos habla por primera vez el padre de Donnie, y más tarde el pedófilo personaje de Patrick Swayze. ¿Es este Frank el conejo y termina muriendo de un disparo en el ojo de manera diferente a como lo había hecho? Para vivir en el bucle y comunicarse con Donnie ha tenido que morir en el bucle, y todo parece indicar que su muerte se produce antes, y no en alguno de los bucles, ya que si fuera asi nadie recordaría su muerte, estaría por venir aún. Punto oscuro.

En el libro ficticio que aparece en la versión Cut's Director, se explica que los muertos en el bucle temporal tienen la posibilidad de comunicarse con el elegido ( Donnie ), éste al mismo tiempo posee gran fuerza y algún que otro poder:

-¿Donnie Darko? ¿Qué clase de nombre es ese? Parece de superhéroe.
-¿qué te hace pensar que no lo soy?

NOTA : La frase que grita Donnie cuando tiene el cuchillo sobre el cuello al final de la peli: "deus ex machina", se traduce del latín: Dios surgido de la máquina. Y actualmente se utiliza para referirse a "un elemento externo que resuelve una historia sin seguir su lógica interna".