Después del encuentro de Freder con María en las catacumbas, Rotwang persigue a esta última, la secuestra y la lleva a su laboratorio, donde tiene un antropomorfo «ser-máquina» al que quiere dar una apariencia idéntica a la de María (y, así, poder suplantarla). El laboratorio de Rotwang recuerda, por sus haces de hilos que se pierden en las alturas y por su red de matraces y frascos interconectados, a ciertas pinturas de Remedios Varo. En todo caso, Rotwang consigue su objetivo: el «ser-máquina» acaba resultando idéntico a María y es enviado a las profundidades para acabar con la rebelión que dirigía su «alter ego» humana. Pero antes, el «ser-máquina» es presentado a la flor y nata de la sociedad, momento en el cual Freder entrevé a la Muerte, rodeada de los siete pecados capitales, silbando sobre un hueso como si fuera el flautista de Hamelín. Más tarde, el «ser-máquina» desciende hasta las catacumbas para enardecer a las masas obreras, buscando que éstas cometan actos violentos que legitimen una reacción sin cuartel por parte de la burguesía. Los obreros, frenéticos, guiados por el «ser-máquina», se dirigen hacia las máquinas para «matarlas». Mientras tanto, con algo de fortuna, María consigue escapar de la casa de Rotwang (la cual, por lo demás, trae a la memoria la casa de la bruja de Hansel y Gretel; eso sí, perdida en un bosque de hormigón) y se decide a bajar a la ciudad subterránea (al tiempo que su «doble» huye sin ser visto). La «máquina-corazón», víctima del furor obrero, después de agonizar entre chispazos, «muere», y ello provoca la inundación de la ciudad subterránea. Los obreros, al advertir las consecuencias de sus acciones, buscan a María (en realidad, al «ser-máquina»), a quien culpan de la desgracia por haberles enardecido, para matarla; sin embargo, a la que encuentran es a la verdadera María, que había estado, momentos antes, salvando del ahogamiento a los hijos de los obreros. Con todo, dado que, por casualidad, las dos Marías cruzan sus caminos, los obreros acaban capturando a la María mecánica y descubren su verdadera naturaleza al quemarla en la hoguera por bruja. Pero aún hay más: la verdadera María, perseguida por Rotwang, se cobija en una iglesia, y Freder, que había acudido a socorrerla, tira, entre las muecas burlonas de las gárgolas, a Rotwang desde la cubierta de la iglesia. ¡Menudo baile! Al final, Fredersen y los obreros sellan la paz gracias a la mediación de Freder. La película se cierra con una candorosa fórmula que debe descifrarse: «el mediador entre el cerebro [burguesía] y las manos [proletariado] ha de ser el corazón». El mediador podría interpretarse como un «aufheben» hegeliano, esto es, un negar y un conservar a la vez, un cancelar superando, una síntesis superadora capaz de evitar una negación aniquiladora (contra la que se rebela el corazón). Algo que, acaso, podría vincularse al tercerposicionismo de la época.