Yo dividiría la película en 4 partes que serían: un sueño, el presente, un recuerdo y la locura.
El sueño se inicia desde el principio, la cámara acercándose a la almohada es un claro signo, y acaba cuando abren la caja azul y cae al suelo. En esta parte aparecen muchas cosas sin lógica (el cowboy, la escena de los dos hombres en la cafetería hablando de un sueño, la historia del matón, la obra del teatro "Silencio"...) porque como cada vez que soñamos, lo hacemos sin lógica pero pueden aparecer imágenes vividas (al cowboy lo ve en la fiesta, al matón es al que contrata, la casera es la ayudante del director realmente...).
Luego está la parte del presente, que se inicia cuando la vecina, que podría ser la expreja de la protagonista, llama a la chica que duerme en la cama. Su actual "amiga con derecho a roce", enamorada del director, ya está muerta (aparece la llave azul en la mesa). Esta parte no tiene ningún punto de surrealismo.
La siguiente parte es el recuerdo, comienza cuando las dos chicas se besan en el sofá. Durante esta parte recuerda la relación con la chica y su lio con el director, lo que le llena de celos. También carece de imágenes surrealistas.
En la última parte vuelve al presente, justo despues de que la vecina recoja las cosas, pero apareciendo la locura de la protagonista al darse cuenta de que ha matado a la mujer que amaba (la llave que el matón le daría tras asesinarla está en la mesa). Por eso tiene la visión de los viejetes y se suicida.

Vamos, creo que esos puntos extravagantes son utilizados para recrear un sueño (filma una historia sin guión definido pero sin historias imposibles, como los sueños) y la locura (todo son imágenes imposibles, como los abueletes pasando bajo la puerta), siendo Lynch el maestro en ello.