El monolito enviado por extraterrestres enseñando a los monos el camino del raciocinio y dando lugar al hombre moderno.
El monolito enviando una onda al recibir la luz del sol, una onda que cruza el sistema solar y activa los sistemas dejados por los extraterrestres para ascender al hombre (el segundo monolito de saturno) cuando este estuviera listo.
La mente artificial de Hal pensando a velocidades miles de veces superior a la humana, el como no era realmente maldad lo que le guiaba a eliminar a la tripulación si no un choque entre dos ordenes en su programación es decir realmente era el deseo de obedecer sus ordenes lo que le enloquece.
El viaje final a través de la galaxia, utilizando agujeros de gusano, para encontrarse con aparatos dejados por los extraterrestres para ascender a una existencia superior donde ya no es necesario el cuerpo, cuando este estuviera listo.
Todas estas cosas (y algunas otras) son las que en mi opinión la película deja demasiado libres ala interpretación unas más que otras por supuesto. aunque claro esta es una opinión personal otros veran que esto es precisamente lo mejor de la pelicula y quizas tengan razón.