Obviamente los chicos se escapan del complejo, aparecen con extremidades biónicas y son actores jóvenes porque los están sometiendo a pruebas.

Sí, Nomad los deja escapar (fijáos que le da la opción de quedarse al actor principal en el ascensor). Todo el rato los están poniendo a prueba ("la simbiosis perfecta entre humano y tecnología alienígena", llega a comentar). Les interesa esa simbiosis por alguna razón, el comportamiento que tienen tras ser operados es relevante para ellos.

Por eso los trabajadores del complejo casi no hablan y llevan sus tareas a cabo como autómatas.

Por eso hay otros humanos fuera del complejo "renegados" y con comportamiento "defectuoso" (como la señora mayor que acaba entrando en bucle tras ser interrogada).

Nomad pone a prueba sus habilidades adquiridas fuera del complejo (que en realidad es un complejo en sí, una especie de campo de maniobras donde se les testea). Los humanos que lo habitan, probablemente con tecnología menos avanzada o con menos capacidad de aceptarla (quizás por eso los protagonistas son jóvenes y con un nivel cultural e intelectual alto, totalmente al contrario que los demás, aunque esto ya sería una suposición muy valiente) no consiguen salir del complejo ni comprenderlo, no se superan.

Uno de los protagonistas se ve superado por la situación y simplemente entra en un comportamiento autodestructivo y de sacrificio, no acepta la tecnología, se enfrenta a la situación de una manera que no interesa a los alienígenas.

Y sí, la escena final no es el colofón de una bazofia sino la pieza del puzzle que hace encajar a las demás y aclara que se encuentran dentro de un sector (de ahí los tatuajes con números) dentro de un complejo de pruebas con muchísimos más sectores y se encuentran en un lugar o ciudad con tecnología mucho más avanzada (alienígenas probablemente).

Porqué son jóvenes? Probablemente porque los alienígenas se han dado cuenta de que tenían que cambiar de grupo de individuos (y aciertan).

Porqué la chica se despierta del coma? La chica también tiene implantes, concretamente en su espina dorsal, quizás con ella prueban mejoras en la respuesta motora. Igual ni siquiera estaba en coma, Nomad no le cuenta la verdad al protagonista sobre su otro amigo, porqué iba a hacerlo con ella?
Lo que sí es relevante es que ella es en realidad el objeto más preciado para los alienígenas (hasta se la llevan en helicóptero tras el accidente, no se habían molestado en usarlo ni siquiera para perseguirles) Es tan importante ya sea porque no habían acabado de implantarle tecnología cuando el protagonista la rescata o por cualidades adquiridas que no nos son relevadas en la película (o no he sido capaz de comprender).

Porqué hay otros humanos viviendo fuera del complejo? Son parte de la prueba o siguen ellos en fase de pruebas, cuando no se comportan como deben o revelan información a los sujetos en pruebas son eliminados por el supervisor (Nomad).

Porqué la cámara súper lenta? Y porqué no? Es una manera de demostrarnos el poder de la tecnología o simplemente un efecto visual que quiso usar el director para añadir dramatismo.