Lo que no especificaba por no espoilear, era:

¿Desde cuándo estaban muertos? ¿Desde que iban en el mismo vuelo y pasaron por el purgatorio, infierno, cielo y reencuentro para reencarnarse?

Esto era posible porque en la isla había una estatua de Anubis (guardían de los muertos egipcio).
Y Jacob dijo que la isla era como un contenedor, como una botella que contenía las tinieblas.
Además al final, dónde estaba de nuevo el ataud del padre de Jack había un vitral con todos los símbolos de todas las religiones principales.

Pero en la conversación que luego mantiene Jack con su padre muerto al final, él le pregunta si entonces todos fallecieron. Y el padre le responde que unos antes y otros después, pero que allí todo es atemporal.
Por tanto aquí se deduce que lo de la isla no fue en realidad un purgatorio, sino que fue una aventura real.
y que conforme ellos fueron muriendo, fueron viviendo su experiencia celestial, que era esa vida paralela que aparecía, hasta que una vez todos muertos se reunieron de nuevo.

La incógnita es, entonces, que puede ser la isla. Ya que si no es el purgatorio, entonces es una isla extraña y misteriosa en dónde aparecen barcos o aviones que desaparecen como en un triángulo de las bermudas, con sus propios mitos.

No obstante aunque no quede demasiado claro y el final me parece muy triste, me gustó mucho la serie. xD