Incoherencia: ¿Cómo es posible que en la segunda temporada el multiforme mate a Charlie, copie su cuerpo, se quite la ropa de la enfermera, recupere el cadáver de ésta y lo vuelva a vestir, desvista a Charlie y se vista con sus ropas, dejando posteriormente el cuerpo de Charlie entre la ropa sucia del contenedor en apenas unos minutos? Si recordáis, Charlie dispara al multiforme con el cuerpo de la enfermera y los compañeros, que no debían de estar muy lejos, van corriendo al oír los disparos para ayudar. Por lejos que estuvieran, no creo que tardaran más de 3 o 4 minutos y cuando llegan al lugar, ya está el multiforme con la apariencia y el traje de Charlie y el cadáver de la enfermera completamente vestido en el suelo.
¿Cómo puede ser que nadie se diera cuenta, por otro lado, que faltaba un cuerpo en ese momento? ¿No estamos hablando de las mentes más brillantes del FBI? ¿Se quedan simplemente con la explicación de Charlie de que ha matado al multiforme? ¿No se dan cuenta que el supuesto cadáver del multiforme es humano y que faltaría el cuerpo del ser?
Y dos capítulos más tarde, cuando se dan cuenta que el multiforme sigue libre, ¿no sospechan directamente de Charlie, que es quien les contó que lo había matado? ¿Tienen que esperar una confirmación de Massive Dynamic?
Incoherencia: ¿Por qué un cambio tan drástico en el carácter de la Olivia de la realidad alternativa, que es tan enrollada, al pasar a nuestra realidad, donde se convierte en un agente frío y despiadado (a pesar de que percibe desde el primer momento que el otro grupo de Fringe no busca destruir su mundo? Cuando vuelve a su realidad, se vuelve a convertir en una persona amigable y dinámica, nada que ver con esa otra Olivia.
Olvido: ¿Qué pasó con la agente del FBI que ayuda a los protagonistas en la segunda temporada cuando están a punto de cerrar el departamento de Fringe? Esa chica que parece que echa un cable a Peter cuando Olivia está hospitalizada... Parecía que querían introducir un nuevo personaje pero cayó en el olvido.
Olvido: ¿Qué pasó con la hermana y sobrina de Olivia? Por un momento parecen ser importantes en la trama y en la vida de Olivia, y de repente desaparecen de la serie sin muchas explicaciones.
Olvido: ¿Qué sucede con la historia del pasado de Peter? ¿Quién le perseguía? ¿Por qué se ocultaba? ¿Quién era la chica con la que salía y a la que había un tipo que maltrataba?
Olvido: ¿Y el padrino de Olivia que le enviaba felicitaciones cada año? ¿Apenas se hace mención en algún momento?
Olvido: ¿Y el tipo que salía en el zépelin en el capítulo de animación en la mente de Olivia? En algún momento del capítulo apuntaron que podía ser importante, pero luego nunca más se supo.
Incoherencia: Y por último... ¿qué especie de plan es ese del final de la quinta temporada que se basa en viajar al futuro para presentar a un niño observador al científico que creó a los observadores con la esperanza de que no los invente? ¿Es ese un plan sólido para salvar a la tierra? Es más... si los observadores han viajado al pasado, al 2015 para conquistar la tierra, eso hace que el futuro automáticamente cambie, que no exista tal y como sucedió, con lo que no habrá un científico que quiera crear a los observadores pues éstos ya existen.
En definitiva, cuando se trata con temáticas de realidades alternativas y viajes en el tiempo es fácil caer en incoherencias como éstas.

Por qué esa obsesión de enviar siempre a ambos protagonistas al suelo?

Los actores protagonistas aseguran que no son tan cretinos como sus personajes.