Sheeta está secuestrada por Muska cuando unos piratas entraron en la nave con la misma misión que el hombre que la tiene secuestrado: robar la piedra que la niña tiene en el cuello.
La trama es muy original, pues resulta que la piedra es una llave para ir a la isla en el cielo: ''Laputa''.
Sheeta utiliza la entrada de los piratas a la nave para escapar y finalmente logra escapar, aunque Muska se entere.
Sheeta cae lentamente por el poder de la piedra, que puede elevar a personas.
Pazu, un niño que se percata de la caída de la niña, le coge y le establece en su casa hasta la mañana, cuando Sheeta ve que tiene una fotografía de ''Laputa'', que hizo su padre.
Aunque Muska y los piratas les persigan. Al final, Muska coge a los dos niños y los lleva a la base militar.
Encierra a Pazu y habla con Sheeta. Le enseña un robot que cayó del cielo y le menciona y miente que ésa es una fortaleza de terror y que si le ayudaba, dejaría a Pazu estar en libertad.
Sheeta le dice que sí, puesto que quiere que deje a Pazu en libertad.
Él regresa a su hogar pero encuentra a la banda de Dora y escuchan por la radio que la niña va a subir en Goliat para indicarles la dirección de la isla.
Así, los piratas y el niño se alían y van en busca de Sheeta.
Ésta recuerda el hechizo que le dijo su abuela que era útil para cuándo estuviera en apuros, que era ''Leete Latobarita Uruth Ariaroth Bal Netoreel'' y lo dice. Al decirlo, una luz indicando el lugar donde está ''Laputa'' sale de la piedra y activa también el robot, que destruye todo a su paso.
Muska y los militares disparan a el robot que aún así dándole, se vuelve a levantar y también rompen la cuerda que sostiene la piedra y le deja inconsciente a Sheeta.
El robot la lleva encima, protegiéndola y la deja en el suelo ya que sabia que iba a recibir un cañonazo del Goliat.
Y finalmente, huyen dejando un muro de humo al Goliat.
Muska y los demás utilizan el colgante con la piedra, el cual aún funciona. Los niños les dicen a la banda de Dora que trabajarán a cambio de que les lleven a ''Laputa''. Pazu trabajará como becario de ingeniero y Sheeta como cocinera.
Por la noche, cuando el turno de vigilancia es de Pazu, Sheeta sube y le menciona que odia tener esa piedra y que sabe más hechizos pero Pazu le tranquiliza. El niño recuerda que su padre le dijo que ''Laputa'' está al otro lado del este.
Cuando la nave está a punto de entrar en la isla, el Goliat dispara a su nave, pero aún así logran entrar.
Muska saquea la isla y ata a los piratas, mientras que el niño sube por un lado de la isla para desatar a los piratas y aunque Muska y los demás se percatan la niña los despista tirándose contra ellos.
Pazu los desata y Dora le da munición. Mientras Muska y la niña está en el núcleo de la isla le menciona que pudo entrar porque sólo la família real puede entrar y que su verdadero nombre es ''Romooska Paro Ul Laputa'' donde hay 2 piedras, una levitando y otra negra. Con la piedra negra y la piedra de Sheeta, tiene la isla en sus manos.
Pero Sheeta arrebata la piedra mágica del colgante y se la da a Pazu. Muska amenaza a Sheeta a muerte pero Pazu le dice que como le mate, ha escondido la piedra y no le dirá dónde está y le dice que quiere hablar con ella.
Entonces le pregunta a Sheeta el hechizo de destrucción, que es ''Balse''.
Toda la isla se desmorona excepto la parte de arriba, donde hay toda la naturaleza y se va elevando poco a poco.
Los niños, enredados en la ramas de los árboles consiguen salir de allí, lo que supone una alegría para la banda de Dora, que habían cogido un pequeño botín.
La película acaba y al final la banda de Dora se va a vivir en su hogar, al igual que los dos niños.
He explicado un gran resumen y arriba la crítica de esta gran película.