Para empezar, debemos tener claro que no es una película aislada, sino que, se quiera o no, forma parte de la saga de alien, y de su universo. Una vez tengamos esto en cuenta, podemos empezar a deducir.
-El tema de las instalaciones de los ingenieros y cual era su propósito, no ofrece muchas dudas, ya que los propios protagonistas lo deducen.
-El misterioso líquido negro del principio, no tiene que ser necesariamente el de las vasijas, simplemente es un líquido oscuro, como el vino y la coca-cola.
-La película se sitúa unos 30 años antes que la primera entrega de alien, y cuando los tripulantes del Nostromo descubren la nave alienígena, el piloto estaba fosilizado, por lo que evidentemente llevaba más de tres décadas ahí, y todos sabemos cual era su valiosa carga. Por lo que, es imposible que lo que vemos al final de la cinta, sea el "primer alien".
-Creo que el líquido negro de las vasijas, es una especie de experimento de los ingenieros, con ADN de alien, (que por cierto sale en un mural lo que parece ser una reina), ya que la lombriz que muta, tiene sangre ácida, y al entrar en contacto con shaw comienza a gestar una especie de facehugger primitivo, y dicho animalito, al atrapar al ingeniero, da como resultado ese "proto-alien". Pero de ningún modo creo que sea el origen como bien he dicho, sino un cúmulo de casualidades y devenires genéticos que dan como resultado algo parecido a la "fuente" del susodicho líquido negro.
-En cuanto a la posibilidad de una segunda parte...Viendo lo prolífico que es el señor Ridley Scott, creo que tendremos que esperar muchos pero que muchos años para que vea la luz.
Dicho todo esto, finalizo pidiendo perdón si a alguien todo esto le parece absurdo, como bien digo son mis propias conjeturas, basadas en mis puntos de vista, y que poco o nada tiene que ver con una crítica en sentido escricto, pero me parece muy interesante compartirlo.