Si bien esta película está destinada a sacar el mayor provecho de la licencia pokemon y agrandar su imperio, la idea original del creador (del juego), Satoshi Tajiri, donde podemos ver parte del argumento, es demasiado notable.

Un grupo de científicos ha estado trabajando para crear al Pokemon más poderoso nunca antes visto. Para ello han tomado una muestra de ADN de un pokemon fosilizado descubierto en el amazonas llamado mew. Este ser clonado de Mew resulta ser Mewtwo, una creación que, sin entender su propósito en el mundo, decide vengarse de este, destruir toda vida y crear un nuevo mundo. Aquí interviene el personaje principal de la serie Ash, que deberá detener los planes del siniestro Pokemon.

Sin duda por ser para niños el argumento es inteligente pero esta planteado de una forma comercial y para nada aprovechada.