Jason Bourne es un hombre sin identidad que aparece cerca de Marsella, rescatado por una embarcación italiana. No sabe quien es ni como llegó hasta aquí, y eso es lo que quiere descubrir.
Contará con la ayuda de Franka Potente, una mujer con problemas a la que le va la marcha (y mucho).
Jason Bourne solo contaba con unas balas y un número de cuenta en un banco suizo. En su caja de seguridad del banco tenía muchísimo dinero, una pístola y un sinfín de pasaportes falsos.
Además, posee unas cualidades físicas y mentales muy superior a los demás, parece estar preparado para todo.
Finalmente descubre quien es, un espía de élite al que se le asignó una misión que no pudo cumplir (no por calidad, sino por pena). Al no cumplirla fue herido y rescatado por el barco italiano. Desde ahí y con su pérdida de memoria tiene que hacer frente a numerosos problemas. A raíz del incumplimiento de la misión, el hábil francotirador Clive Owen le persigue para matarlo, pero tampoco puede con Jason, quién termina matando prácticamente a todos y volviendo con Franka Potente.